Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC174Q6PII3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms