Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8BQ6P9F7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8BQ6P9F7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms