Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDC42EP5Q6NZY7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC42EP5Q6NZY7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms