Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEPROQ6NW34 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms