Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOCADQ5VW36 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
FOCADQ5VW36 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms