Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC122Q5T0U0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC122Q5T0U0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC122Q5T0U0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC122Q5T0U0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC122Q5T0U0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC122Q5T0U0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC122Q5T0U0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC122Q5T0U0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC122Q5T0U0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC122Q5T0U0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC122Q5T0U0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms