Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LDLRAP1Q5SW96 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LDLRAP1Q5SW96 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms