Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC39AQ5SRH9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC39AQ5SRH9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC39AQ5SRH9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms