Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TDRD12Q587J7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TDRD12Q587J7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD12Q587J7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms