Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KLHL12Q53G59 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLHL12Q53G59 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms