Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC38Q502W7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC38Q502W7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC38Q502W7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms