Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC1Q4ZHG4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms