Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf22Q49AR2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf22Q49AR2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms