Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TSR1Q2NL82 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms