Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTC1Q2NKJ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTC1Q2NKJ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms