Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZIC1Q15915 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZIC1Q15915 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
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