Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
VPS72Q15906 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms