Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3A1Q15459 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3A1Q15459 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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