Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1I3Q14994 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NR1I3Q14994 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR1I3Q14994 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
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