Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCARF1Q14162 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCARF1Q14162 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCARF1Q14162 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
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