Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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