Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
COL9A3Q14050 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL9A3Q14050 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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