Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCINQ13939 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCINQ13939 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCINQ13939 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCINQ13939 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCINQ13939 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCINQ13939 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCINQ13939 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCINQ13939 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCINQ13939 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCINQ13939 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCINQ13939 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCINQ13939 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCINQ13939 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCINQ13939 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCINQ13939 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCINQ13939 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCINQ13939 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCINQ13939 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCINQ13939 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCINQ13939 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCINQ13939 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCINQ13939 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCINQ13939 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCINQ13939 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCINQ13939 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCINQ13939 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCINQ13939 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCINQ13939 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCINQ13939 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCINQ13939 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCINQ13939 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCINQ13939 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCINQ13939 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCINQ13939 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCINQ13939 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCINQ13939 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCINQ13939 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCINQ13939 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCINQ13939 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCINQ13939 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCINQ13939 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCINQ13939 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCINQ13939 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCINQ13939 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCINQ13939 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCINQ13939 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCINQ13939 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCINQ13939 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCINQ13939 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCINQ13939 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCINQ13939 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCINQ13939 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCINQ13939 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCINQ13939 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCINQ13939 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCINQ13939 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCINQ13939 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCINQ13939 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCINQ13939 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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CCINQ13939 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCINQ13939 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCINQ13939 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCINQ13939 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCINQ13939 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCINQ13939 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCINQ13939 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCINQ13939 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCINQ13939 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCINQ13939 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCINQ13939 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCINQ13939 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCINQ13939 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCINQ13939 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCINQ13939 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCINQ13939 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCINQ13939 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCINQ13939 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCINQ13939 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCINQ13939 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCINQ13939 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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