Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDZK1IP1Q13113 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDZK1IP1Q13113 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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