Protein–RNA interactions for Protein: Q12196

RIO1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIO1Q12196 ARP4YJL081C 1470 nt3.46□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 RPA135YPR010C 3612 nt3.45□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 LCB5YLR260W 2064 nt3.45□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 GSC2YGR032W 5688 nt3.45□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 YGR291CYGR291C 222 nt3.45□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 SGN1YIR001C 753 nt3.45□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 MRPL20YKR085C 588 nt3.45□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 YPL073CYPL073C 486 nt3.45□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt3.45□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 FUN12YAL035W 3009 nt3.45□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 DOA4YDR069C 2781 nt3.45□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 TGL3YMR313C 1929 nt3.44□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 YCR050CYCR050C 309 nt3.44□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 GOT1YMR292W 417 nt3.44□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 INN1YNL152W 1230 nt3.44□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 RFC3YNL290W 1023 nt3.44□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 MET10YFR030W 3108 nt3.44□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 YDL176WYDL176W 2127 nt3.44□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 RAD5YLR032W 3510 nt3.44□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 MDL1YLR188W 2088 nt3.43□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 YSP2YDR326C 4317 nt3.43□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 YER085CYER085C 522 nt3.43□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 DLS1YJL065C 504 nt3.43□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 NAT3YPR131C 588 nt3.43□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 GLO3YER122C 1482 nt3.42□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 LST7YGR057C 729 nt3.42□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 YPL014WYPL014W 1146 nt3.42□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 SIP1YDR422C 2448 nt3.42□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 MDM38YOL027C 1722 nt3.41□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 YDR444WYDR444W 2064 nt3.41□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 HIM1YDR317W 1245 nt3.41□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 YHP1YDR451C 1062 nt3.41□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 CDC73YLR418C 1182 nt3.41□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 RSF1YMR030W 1131 nt3.41□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 SAS5YOR213C 747 nt3.41□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 YPR077CYPR077C 372 nt3.41□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 YRB30YGL164C 1323 nt3.41□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 CHS2YBR038W 2892 nt3.41□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 CHO2YGR157W 2610 nt3.4□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 PUB1YNL016W 1362 nt3.4□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 YMR317WYMR317W 3423 nt3.4□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 ROM1YGR070W 3468 nt3.4□□□□□ -1.86
RIO1Q12196 NRP1YDL167C 2160 nt3.4□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 YDL242WYDL242W 354 nt3.4□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 VMA22YHR060W 546 nt3.4□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 YIR043CYIR043C 693 nt3.4□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 VPS21YOR089C 633 nt3.4□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 MSR1YHR091C 1932 nt3.4□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 YDL180WYDL180W 1644 nt3.4□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 PCI8YIL071C 1335 nt3.4□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 MAK21YDR060W 3078 nt3.4□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 TFB2YPL122C 1542 nt3.39□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 VTC4YJL012C 2166 nt3.39□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 PET54YGR222W 882 nt3.39□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 OST6YML019W 999 nt3.39□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 YBL065WYBL065W 345 nt3.39□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 RHO5YNL180C 996 nt3.39□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 YBR134WYBR134W 402 nt3.39□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 SPO71YDR104C 3738 nt3.39□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 ENA5YDR038C 3276 nt3.39□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 INO2YDR123C 915 nt3.38□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 ERJ5YFR041C 888 nt3.38□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 RAI1YGL246C 1164 nt3.38□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 TOM20YGR082W 552 nt3.38□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 YLR124WYLR124W 345 nt3.38□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 YBL029WYBL029W 1131 nt3.38□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 PRX1YBL064C 786 nt3.38□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 RPN6YDL097C 1305 nt3.38□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 RPN1YHR027C 2982 nt3.38□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 ATG26YLR189C 3597 nt3.37□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 SKN7YHR206W 1869 nt3.37□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 GIS4YML006C 2325 nt3.37□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 YFL051CYFL051C 483 nt3.37□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 YHI9YHR029C 885 nt3.37□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 SHQ1YIL104C 1524 nt3.37□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 EXO5YBR163W 1758 nt3.37□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 DXO1YDR370C 1329 nt3.37□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 TDA3YHR009C 1572 nt3.37□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 IOC3YFR013W 2364 nt3.37□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 DHH1YDL160C 1521 nt3.36□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 DET1YDR051C 1005 nt3.36□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 PXR1YGR280C 816 nt3.36□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.36□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 IMP1YMR150C 573 nt3.36□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.36□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 NAT1YDL040C 2565 nt3.36□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 SET4YJL105W 1683 nt3.36□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 MDM1YML104C 3384 nt3.35□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 TAO3YIL129C 7131 nt3.35□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 YHR080CYHR080C 4038 nt3.35□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 CIN8YEL061C 3003 nt3.35□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 SPO74YGL170C 1242 nt3.35□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 YVH1YIR026C 1095 nt3.35□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 LSM1YJL124C 519 nt3.35□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 UNG1YML021C 1080 nt3.35□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 NRG2YBR066C 663 nt3.35□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 SOF1YLL011W 1470 nt3.35□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 CHK1YBR274W 1584 nt3.34□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 RPS18AYDR450W 441 nt3.34□□□□□ -1.87
RIO1Q12196 YPT35YHR105W 645 nt3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.7 ms