Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CPSF1Q10570 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CPSF1Q10570 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CPSF1Q10570 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
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