Protein–RNA interactions for Protein: Q08236

AVO1, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO1Q08236 YLR126CYLR126C 756 nt5.26□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 CDC37YDR168W 1521 nt5.26□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 BRE2YLR015W 1518 nt5.26□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 MMT1YMR177W 1533 nt5.26□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 VID30YGL227W 2877 nt5.26□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 TDA3YHR009C 1572 nt5.25□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 HSP78YDR258C 2436 nt5.25□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.25□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YDL144CYDL144C 1071 nt5.25□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 UBC13YDR092W 462 nt5.25□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YDR271CYDR271C 372 nt5.25□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YER145C-AYER145C-A 438 nt5.25□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.25□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 RPS2YGL123W 765 nt5.25□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 BRR6YGL247W 594 nt5.25□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YML053CYML053C 639 nt5.25□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 GIM5YML094W 492 nt5.25□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YNL058CYNL058C 951 nt5.25□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YNR071CYNR071C 1029 nt5.25□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 DCC1YCL016C 1143 nt5.25□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 FOL1YNL256W 2475 nt5.25□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 FPK1YNR047W 2682 nt5.25□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 GDS1YOR355W 1569 nt5.25□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 RDS2YPL133C 1341 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 FAR10YLR238W 1437 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 HRK1YOR267C 2280 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YCL068CYCL068C 783 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 BSC1YDL037C 987 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 UGX2YDL169C 672 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YDR535CYDR535C 501 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 PEA2YER149C 1263 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 SNX4YJL036W 1272 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 FMP33YJL161W 543 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 POM33YLL023C 840 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YNL035CYNL035C 1170 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 AAD15YOL165C 432 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 RMI1YPL024W 726 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 RFC5YBR087W 1065 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 KAR4YCL055W 1008 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 HUL4YJR036C 2679 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 ASF2YDL197C 1578 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 CET1YPL228W 1650 nt5.24□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt5.23□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt5.23□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt5.23□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YCL020WYCL020W 1317 nt5.23□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YDL050CYDL050C 372 nt5.23□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 NUS1YDL193W 1128 nt5.23□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YJR011CYJR011C 786 nt5.23□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt5.23□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 IRC19YLL033W 693 nt5.23□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 SHP1YBL058W 1272 nt5.23□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 ATG12YBR217W 561 nt5.23□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 BRF1YGR246C 1791 nt5.23□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YGR125WYGR125W 3111 nt5.23□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 SYG1YIL047C 2709 nt5.23□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 NOT3YIL038C 2511 nt5.23□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 HIR1YBL008W 2523 nt5.23□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 ERG4YGL012W 1422 nt5.23□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 SAC1YKL212W 1872 nt5.22□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 CTK1YKL139W 1587 nt5.22□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 PRP31YGR091W 1485 nt5.22□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 CNL1YDR357C 369 nt5.22□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt5.22□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 ZRT1YGL255W 1131 nt5.22□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YGR018CYGR018C 330 nt5.22□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 CBP4YGR174C 513 nt5.22□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YJR087WYJR087W 351 nt5.22□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 ACP1YKL192C 378 nt5.22□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 STM1YLR150W 822 nt5.22□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 COQ9YLR201C 783 nt5.22□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 SYM1YLR251W 594 nt5.22□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YLR252WYLR252W 306 nt5.22□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 IGO1YNL157W 507 nt5.22□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 BUB3YOR026W 1026 nt5.22□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 RET3YPL010W 570 nt5.22□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YML020WYML020W 1995 nt5.22□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 TBF1YPL128C 1689 nt5.21□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 YGR266WYGR266W 2106 nt5.21□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 GRS1YBR121C 2004 nt5.21□□□□□ -1.57
AVO1Q08236 UBX3YDL091C 1368 nt5.21□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 SPL2YHR136C 447 nt5.21□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 YJL028WYJL028W 336 nt5.21□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 YKR011CYKR011C 1062 nt5.21□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 YAR030CYAR030C 342 nt5.21□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 HFA1YMR207C 6372 nt5.21□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 PSF3YOL146W 585 nt5.21□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 YOR387CYOR387C 621 nt5.21□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 RPS9AYPL081W 594 nt5.21□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 POL30YBR088C 777 nt5.21□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.21□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt5.21□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 MRK1YDL079C 1506 nt5.21□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 AMD1YML035C 2433 nt5.21□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 SST2YLR452C 2097 nt5.2□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 NGL3YML118W 1518 nt5.2□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 SEC20YDR498C 1152 nt5.2□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 THG1YGR024C 714 nt5.2□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 YKE4YIL023C 1041 nt5.2□□□□□ -1.58
AVO1Q08236 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.2 ms