Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL16A1Q07092 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
COL16A1Q07092 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
COL16A1Q07092 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL16A1Q07092 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL16A1Q07092 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL16A1Q07092 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms