Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAX8Q06710 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX8Q06710 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms