Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 TAO3YIL129C 7131 nt2.75□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 YRB30YGL164C 1323 nt2.75□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 DYN2YDR424C 279 nt2.75□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 LST7YGR057C 729 nt2.75□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 ARD1YHR013C 717 nt2.75□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 TIR2YOR010C 756 nt2.75□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 PRS5YOL061W 1491 nt2.75□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 SPT10YJL127C 1923 nt2.75□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 PUF2YPR042C 3228 nt2.75□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 SNQ2YDR011W 4506 nt2.75□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 SMP3YOR149C 1551 nt2.74□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 THR4YCR053W 1545 nt2.74□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 PFA5YDR459C 1125 nt2.74□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt2.74□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt2.74□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt2.74□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 MOH1YBL049W 417 nt2.74□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 UBP5YER144C 2418 nt2.74□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 PUB1YNL016W 1362 nt2.74□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 CTR86YCR054C 1692 nt2.73□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 PRM2YIL037C 1971 nt2.73□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 PSF1YDR013W 627 nt2.73□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 RPA14YDR156W 414 nt2.73□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 YHI9YHR029C 885 nt2.73□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 FUR1YHR128W 651 nt2.73□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 YKL091CYKL091C 933 nt2.73□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 PRX1YBL064C 786 nt2.73□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 BUD21YOR078W 645 nt2.73□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt2.73□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 RAD4YER162C 2265 nt2.73□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 SLA1YBL007C 3735 nt2.73□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 CDH1YGL003C 1701 nt2.73□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 MDM38YOL027C 1722 nt2.73□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 TCM62YBR044C 1719 nt2.73□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 BUD4YJR092W 4344 nt2.72□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 SRC1YML034W 2505 nt2.72□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 YEL028WYEL028W 462 nt2.72□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 COS12YGL263W 1143 nt2.72□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 TIM21YGR033C 720 nt2.72□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 BAT2YJR148W 1131 nt2.72□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 PHD1YKL043W 1101 nt2.72□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 YKL050CYKL050C 2769 nt2.72□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 RPL17AYKL180W 555 nt2.72□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 COX19YLL018C-A 297 nt2.72□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 CDC73YLR418C 1182 nt2.72□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 YBL010CYBL010C 843 nt2.72□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 SNO1YMR095C 675 nt2.72□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 ASI2YNL159C 870 nt2.72□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 POC4YPL144W 447 nt2.72□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 ORC4YPR162C 1590 nt2.72□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 CCT7YJL111W 1653 nt2.72□□□□□ -1.97
UPS3Q04006 TRM13YOL125W 1431 nt2.71□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 MIX14YDR031W 366 nt2.71□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 YGR015CYGR015C 987 nt2.71□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 YPT35YHR105W 645 nt2.71□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 HTA2YBL003C 399 nt2.71□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 RPN13YLR421C 471 nt2.71□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 YBR300CYBR300C 498 nt2.71□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 MAK21YDR060W 3078 nt2.71□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 MIF2YKL089W 1650 nt2.7□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 IGO2YHR132W-A 396 nt2.7□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 YHR173CYHR173C 339 nt2.7□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 YIL025CYIL025C 375 nt2.7□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 PSR1YLL010C 1284 nt2.7□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 JLP1YLL057C 1239 nt2.7□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 EMG1YLR186W 759 nt2.7□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt2.7□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 ULP1YPL020C 1866 nt2.7□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 ARG5,6YER069W 2592 nt2.7□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 TYR1YBR166C 1359 nt2.7□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 MSR1YHR091C 1932 nt2.7□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 STU2YLR045C 2667 nt2.69□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 SPS2YDR522C 1509 nt2.69□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 DPB4YDR121W 591 nt2.69□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 YDR442WYDR442W 393 nt2.69□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 SCM4YGR049W 564 nt2.69□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 UTP11YKL099C 753 nt2.69□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 FLD1YLR404W 858 nt2.69□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 VAM10YOR068C 345 nt2.69□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 SPN1YPR133C 1233 nt2.69□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 CKS1YBR135W 453 nt2.69□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 IMD4YML056C 1575 nt2.69□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 NDT80YHR124W 1884 nt2.69□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 COP1YDL145C 3606 nt2.68□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt2.68□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 MSW1YDR268W 1140 nt2.68□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 VTA1YLR181C 993 nt2.68□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 YNR071CYNR071C 1029 nt2.68□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 RET3YPL010W 570 nt2.68□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 SUI3YPL237W 858 nt2.68□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 DIB1YPR082C 432 nt2.68□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 SIR1YKR101W 1965 nt2.68□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 VID27YNL212W 2349 nt2.68□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 NPL4YBR170C 1743 nt2.68□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 CNA1YLR433C 1662 nt2.67□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 COS7YDL248W 1152 nt2.67□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 YDR271CYDR271C 372 nt2.67□□□□□ -1.98
UPS3Q04006 RAI1YGL246C 1164 nt2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.9 ms