Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLH1Q02575 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NHLH1Q02575 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NHLH1Q02575 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NHLH1Q02575 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NHLH1Q02575 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NHLH1Q02575 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NHLH1Q02575 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms