Protein–RNA interactions for Protein: Q02086

SP2, Transcription factor Sp2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP2Q02086 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP2Q02086 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP2Q02086 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP2Q02086 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP2Q02086 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP2Q02086 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP2Q02086 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP2Q02086 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP2Q02086 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP2Q02086 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP2Q02086 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP2Q02086 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP2Q02086 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP2Q02086 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP2Q02086 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SP2Q02086 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP2Q02086 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP2Q02086 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP2Q02086 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP2Q02086 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP2Q02086 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP2Q02086 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP2Q02086 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP2Q02086 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP2Q02086 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP2Q02086 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP2Q02086 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP2Q02086 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP2Q02086 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP2Q02086 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP2Q02086 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP2Q02086 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP2Q02086 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP2Q02086 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP2Q02086 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP2Q02086 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP2Q02086 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP2Q02086 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SP2Q02086 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SP2Q02086 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SP2Q02086 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SP2Q02086 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SP2Q02086 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SP2Q02086 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP2Q02086 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP2Q02086 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP2Q02086 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP2Q02086 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP2Q02086 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP2Q02086 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP2Q02086 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP2Q02086 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SP2Q02086 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP2Q02086 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP2Q02086 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP2Q02086 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP2Q02086 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP2Q02086 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP2Q02086 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP2Q02086 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP2Q02086 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP2Q02086 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP2Q02086 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP2Q02086 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP2Q02086 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP2Q02086 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP2Q02086 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP2Q02086 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP2Q02086 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP2Q02086 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP2Q02086 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP2Q02086 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP2Q02086 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP2Q02086 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP2Q02086 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SP2Q02086 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP2Q02086 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP2Q02086 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP2Q02086 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SP2Q02086 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP2Q02086 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP2Q02086 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP2Q02086 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP2Q02086 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP2Q02086 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP2Q02086 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP2Q02086 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP2Q02086 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP2Q02086 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP2Q02086 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP2Q02086 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SP2Q02086 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP2Q02086 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP2Q02086 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP2Q02086 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP2Q02086 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP2Q02086 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP2Q02086 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP2Q02086 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SP2Q02086 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms