Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRCDQ00LT1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRCDQ00LT1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms