Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFAMQ00059 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TFAMQ00059 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms