Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA4Q00056 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA4Q00056 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms