Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRB1P82279 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRB1P82279 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRB1P82279 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRB1P82279 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRB1P82279 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRB1P82279 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRB1P82279 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRB1P82279 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRB1P82279 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRB1P82279 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRB1P82279 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRB1P82279 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRB1P82279 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRB1P82279 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRB1P82279 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRB1P82279 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRB1P82279 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRB1P82279 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRB1P82279 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CRB1P82279 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRB1P82279 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CRB1P82279 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRB1P82279 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRB1P82279 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRB1P82279 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRB1P82279 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRB1P82279 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRB1P82279 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CRB1P82279 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CRB1P82279 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRB1P82279 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRB1P82279 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CRB1P82279 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CRB1P82279 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CRB1P82279 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CRB1P82279 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CRB1P82279 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CRB1P82279 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CRB1P82279 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CRB1P82279 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRB1P82279 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRB1P82279 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRB1P82279 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CRB1P82279 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRB1P82279 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRB1P82279 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRB1P82279 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRB1P82279 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRB1P82279 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRB1P82279 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRB1P82279 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRB1P82279 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CRB1P82279 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRB1P82279 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRB1P82279 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CRB1P82279 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRB1P82279 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRB1P82279 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CRB1P82279 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRB1P82279 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRB1P82279 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRB1P82279 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRB1P82279 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRB1P82279 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRB1P82279 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRB1P82279 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRB1P82279 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRB1P82279 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CRB1P82279 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRB1P82279 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRB1P82279 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRB1P82279 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CRB1P82279 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRB1P82279 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRB1P82279 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRB1P82279 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRB1P82279 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRB1P82279 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRB1P82279 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRB1P82279 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRB1P82279 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRB1P82279 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRB1P82279 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRB1P82279 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRB1P82279 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRB1P82279 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CRB1P82279 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CRB1P82279 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CRB1P82279 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CRB1P82279 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
CRB1P82279 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CRB1P82279 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CRB1P82279 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRB1P82279 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRB1P82279 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRB1P82279 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRB1P82279 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRB1P82279 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRB1P82279 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms