Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX3P78415 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX3P78415 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX3P78415 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX3P78415 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX3P78415 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX3P78415 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX3P78415 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX3P78415 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX3P78415 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX3P78415 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX3P78415 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX3P78415 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX3P78415 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX3P78415 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX3P78415 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX3P78415 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX3P78415 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX3P78415 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX3P78415 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX3P78415 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IRX3P78415 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IRX3P78415 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX3P78415 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX3P78415 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX3P78415 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX3P78415 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX3P78415 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX3P78415 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX3P78415 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX3P78415 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX3P78415 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX3P78415 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX3P78415 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX3P78415 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX3P78415 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX3P78415 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX3P78415 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX3P78415 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX3P78415 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX3P78415 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX3P78415 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX3P78415 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX3P78415 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX3P78415 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX3P78415 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX3P78415 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX3P78415 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX3P78415 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX3P78415 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX3P78415 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX3P78415 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX3P78415 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX3P78415 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX3P78415 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX3P78415 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX3P78415 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX3P78415 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX3P78415 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX3P78415 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX3P78415 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX3P78415 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX3P78415 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX3P78415 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX3P78415 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX3P78415 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX3P78415 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX3P78415 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX3P78415 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX3P78415 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX3P78415 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX3P78415 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX3P78415 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX3P78415 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX3P78415 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX3P78415 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX3P78415 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX3P78415 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX3P78415 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX3P78415 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX3P78415 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX3P78415 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRX3P78415 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX3P78415 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX3P78415 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX3P78415 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX3P78415 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX3P78415 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX3P78415 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX3P78415 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRX3P78415 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX3P78415 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX3P78415 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX3P78415 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX3P78415 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX3P78415 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX3P78415 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX3P78415 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX3P78415 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRX3P78415 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms