Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UFM1P61960 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UFM1P61960 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UFM1P61960 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UFM1P61960 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UFM1P61960 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UFM1P61960 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UFM1P61960 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UFM1P61960 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UFM1P61960 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UFM1P61960 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UFM1P61960 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UFM1P61960 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UFM1P61960 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UFM1P61960 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UFM1P61960 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UFM1P61960 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UFM1P61960 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UFM1P61960 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UFM1P61960 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UFM1P61960 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UFM1P61960 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UFM1P61960 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UFM1P61960 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UFM1P61960 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UFM1P61960 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UFM1P61960 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UFM1P61960 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UFM1P61960 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UFM1P61960 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UFM1P61960 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UFM1P61960 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UFM1P61960 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UFM1P61960 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UFM1P61960 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UFM1P61960 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UFM1P61960 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UFM1P61960 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UFM1P61960 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UFM1P61960 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UFM1P61960 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UFM1P61960 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UFM1P61960 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UFM1P61960 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UFM1P61960 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UFM1P61960 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UFM1P61960 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UFM1P61960 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UFM1P61960 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UFM1P61960 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UFM1P61960 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UFM1P61960 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UFM1P61960 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UFM1P61960 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UFM1P61960 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms