Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR2FP61218 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2FP61218 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms