Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2NP61088 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms