Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP25P60880 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP25P60880 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms