Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RIPK4P57078 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIPK4P57078 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms