Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC12A2P55011 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC12A2P55011 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms