Protein–RNA interactions for Protein: P53011

SEH1, Nucleoporin SEH1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEH1P53011 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.57□□□□□ -1.84
SEH1P53011 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.57□□□□□ -1.84
SEH1P53011 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.57□□□□□ -1.84
SEH1P53011 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.57□□□□□ -1.84
SEH1P53011 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.57□□□□□ -1.84
SEH1P53011 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.57□□□□□ -1.84
SEH1P53011 MRPL6YHR147C 645 nt3.57□□□□□ -1.84
SEH1P53011 GEM1YAL048C 1989 nt3.57□□□□□ -1.84
SEH1P53011 YAL065CYAL065C 387 nt3.57□□□□□ -1.84
SEH1P53011 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt3.57□□□□□ -1.84
SEH1P53011 FAR8YMR029C 1572 nt3.57□□□□□ -1.84
SEH1P53011 ASC1YMR116C 960 nt3.57□□□□□ -1.84
SEH1P53011 TIF34YMR146C 1044 nt3.57□□□□□ -1.84
SEH1P53011 POL1YNL102W 4407 nt3.57□□□□□ -1.84
SEH1P53011 YPL162CYPL162C 822 nt3.57□□□□□ -1.84
SEH1P53011 YBR225WYBR225W 2703 nt3.57□□□□□ -1.84
SEH1P53011 GAT2YMR136W 1683 nt3.56□□□□□ -1.84
SEH1P53011 PUB1YNL016W 1362 nt3.56□□□□□ -1.84
SEH1P53011 FKH2YNL068C 2589 nt3.56□□□□□ -1.84
SEH1P53011 snR63snR63 255 nt3.56□□□□□ -1.84
SEH1P53011 YGR219WYGR219W 342 nt3.56□□□□□ -1.84
SEH1P53011 COS8YHL048W 1146 nt3.56□□□□□ -1.84
SEH1P53011 GEP4YHR100C 558 nt3.56□□□□□ -1.84
SEH1P53011 RSM25YIL093C 795 nt3.56□□□□□ -1.84
SEH1P53011 HIS5YIL116W 1158 nt3.56□□□□□ -1.84
SEH1P53011 IST1YNL265C 897 nt3.56□□□□□ -1.84
SEH1P53011 IRC14YOR135C 342 nt3.56□□□□□ -1.84
SEH1P53011 SCD6YPR129W 1050 nt3.56□□□□□ -1.84
SEH1P53011 MNR2YKL064W 2910 nt3.55□□□□□ -1.84
SEH1P53011 HMS1YOR032C 1305 nt3.55□□□□□ -1.84
SEH1P53011 MSW1YDR268W 1140 nt3.55□□□□□ -1.84
SEH1P53011 IES6YEL044W 501 nt3.55□□□□□ -1.84
SEH1P53011 RPS0AYGR214W 759 nt3.55□□□□□ -1.84
SEH1P53011 YJL028WYJL028W 336 nt3.55□□□□□ -1.84
SEH1P53011 FLD1YLR404W 858 nt3.55□□□□□ -1.84
SEH1P53011 MCM1YMR043W 861 nt3.55□□□□□ -1.84
SEH1P53011 YBL059WYBL059W 582 nt3.55□□□□□ -1.84
SEH1P53011 NIS1YNL078W 1224 nt3.55□□□□□ -1.84
SEH1P53011 IDH2YOR136W 1110 nt3.55□□□□□ -1.84
SEH1P53011 REB1YBR049C 2433 nt3.55□□□□□ -1.84
SEH1P53011 AIM14YGL160W 1713 nt3.55□□□□□ -1.84
SEH1P53011 YDR222WYDR222W 1248 nt3.54□□□□□ -1.84
SEH1P53011 SDT1YGL224C 843 nt3.54□□□□□ -1.84
SEH1P53011 YHR173CYHR173C 339 nt3.54□□□□□ -1.84
SEH1P53011 SPO20YMR017W 1194 nt3.54□□□□□ -1.84
SEH1P53011 YBL036CYBL036C 774 nt3.54□□□□□ -1.84
SEH1P53011 ACE2YLR131C 2313 nt3.54□□□□□ -1.84
SEH1P53011 CLB5YPR120C 1308 nt3.53□□□□□ -1.84
SEH1P53011 BIK1YCL029C 1323 nt3.53□□□□□ -1.84
SEH1P53011 MAG1YER142C 891 nt3.53□□□□□ -1.84
SEH1P53011 HIS6YIL020C 786 nt3.53□□□□□ -1.84
SEH1P53011 RAD10YML095C 633 nt3.53□□□□□ -1.84
SEH1P53011 MCK1YNL307C 1128 nt3.53□□□□□ -1.84
SEH1P53011 YNR071CYNR071C 1029 nt3.53□□□□□ -1.84
SEH1P53011 PSF3YOL146W 585 nt3.53□□□□□ -1.84
SEH1P53011 GPI2YPL076W 843 nt3.53□□□□□ -1.84
SEH1P53011 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt3.53□□□□□ -1.84
SEH1P53011 POL31YJR006W 1464 nt3.53□□□□□ -1.84
SEH1P53011 TDA3YHR009C 1572 nt3.52□□□□□ -1.85
SEH1P53011 RPB2YOR151C 3675 nt3.52□□□□□ -1.85
SEH1P53011 FMP10YER182W 735 nt3.52□□□□□ -1.85
SEH1P53011 ADH4YGL256W 1149 nt3.52□□□□□ -1.85
SEH1P53011 BAT2YJR148W 1131 nt3.52□□□□□ -1.85
SEH1P53011 YMR084WYMR084W 789 nt3.52□□□□□ -1.85
SEH1P53011 RPL18AYOL120C 561 nt3.52□□□□□ -1.85
SEH1P53011 MED7YOL135C 669 nt3.52□□□□□ -1.85
SEH1P53011 snR17asnR17a 333 nt3.52□□□□□ -1.85
SEH1P53011 VPS27YNR006W 1869 nt3.52□□□□□ -1.85
SEH1P53011 LTV1YKL143W 1392 nt3.51□□□□□ -1.85
SEH1P53011 TAF6YGL112C 1551 nt3.51□□□□□ -1.85
SEH1P53011 SRP72YPL210C 1923 nt3.51□□□□□ -1.85
SEH1P53011 YDL026WYDL026W 312 nt3.51□□□□□ -1.85
SEH1P53011 BMT5YIL096C 1011 nt3.51□□□□□ -1.85
SEH1P53011 RPC17YJL011C 486 nt3.51□□□□□ -1.85
SEH1P53011 RUF21RUF21 707 nt3.51□□□□□ -1.85
SEH1P53011 ASI2YNL159C 870 nt3.51□□□□□ -1.85
SEH1P53011 MRPL37YBR268W 318 nt3.51□□□□□ -1.85
SEH1P53011 ROD1YOR018W 2514 nt3.51□□□□□ -1.85
SEH1P53011 ATG26YLR189C 3597 nt3.51□□□□□ -1.85
SEH1P53011 STU1YBL034C 4542 nt3.51□□□□□ -1.85
SEH1P53011 NCR1YPL006W 3513 nt3.5□□□□□ -1.85
SEH1P53011 HEF3YNL014W 3135 nt3.5□□□□□ -1.85
SEH1P53011 PPQ1YPL179W 1650 nt3.5□□□□□ -1.85
SEH1P53011 YDR526CYDR526C 471 nt3.5□□□□□ -1.85
SEH1P53011 GTF1YGR102C 552 nt3.5□□□□□ -1.85
SEH1P53011 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt3.5□□□□□ -1.85
SEH1P53011 ARC15YIL062C 465 nt3.5□□□□□ -1.85
SEH1P53011 YOR186WYOR186W 435 nt3.5□□□□□ -1.85
SEH1P53011 FSH3YOR280C 801 nt3.5□□□□□ -1.85
SEH1P53011 STP22YCL008C 1158 nt3.5□□□□□ -1.85
SEH1P53011 PRP3YDR473C 1410 nt3.5□□□□□ -1.85
SEH1P53011 SPT16YGL207W 3108 nt3.5□□□□□ -1.85
SEH1P53011 PRP22YER013W 3438 nt3.49□□□□□ -1.85
SEH1P53011 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.49□□□□□ -1.85
SEH1P53011 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.49□□□□□ -1.85
SEH1P53011 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.49□□□□□ -1.85
SEH1P53011 MTC4YBR255W 2085 nt3.49□□□□□ -1.85
SEH1P53011 CIR1YGR207C 786 nt3.49□□□□□ -1.85
SEH1P53011 PEX21YGR239C 867 nt3.49□□□□□ -1.85
SEH1P53011 ERV29YGR284C 933 nt3.49□□□□□ -1.85
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