Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK4P51957 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK4P51957 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK4P51957 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK4P51957 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK4P51957 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEK4P51957 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEK4P51957 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEK4P51957 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEK4P51957 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEK4P51957 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEK4P51957 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NEK4P51957 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEK4P51957 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEK4P51957 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEK4P51957 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEK4P51957 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEK4P51957 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEK4P51957 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEK4P51957 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK4P51957 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK4P51957 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK4P51957 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK4P51957 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK4P51957 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK4P51957 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK4P51957 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK4P51957 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK4P51957 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK4P51957 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK4P51957 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK4P51957 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK4P51957 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK4P51957 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK4P51957 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK4P51957 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK4P51957 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK4P51957 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK4P51957 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEK4P51957 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK4P51957 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK4P51957 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK4P51957 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK4P51957 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK4P51957 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK4P51957 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK4P51957 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK4P51957 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK4P51957 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK4P51957 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK4P51957 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK4P51957 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK4P51957 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK4P51957 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK4P51957 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK4P51957 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK4P51957 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK4P51957 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK4P51957 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK4P51957 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK4P51957 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK4P51957 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK4P51957 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK4P51957 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK4P51957 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK4P51957 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK4P51957 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK4P51957 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK4P51957 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK4P51957 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK4P51957 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK4P51957 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK4P51957 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK4P51957 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK4P51957 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK4P51957 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK4P51957 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK4P51957 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK4P51957 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK4P51957 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK4P51957 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK4P51957 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEK4P51957 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEK4P51957 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK4P51957 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK4P51957 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK4P51957 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK4P51957 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK4P51957 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK4P51957 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK4P51957 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK4P51957 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK4P51957 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK4P51957 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms