Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTCFP49711 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CTCFP49711 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTCFP49711 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTCFP49711 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTCFP49711 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTCFP49711 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTCFP49711 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTCFP49711 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTCFP49711 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTCFP49711 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTCFP49711 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTCFP49711 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTCFP49711 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTCFP49711 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTCFP49711 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTCFP49711 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTCFP49711 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTCFP49711 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTCFP49711 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTCFP49711 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTCFP49711 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTCFP49711 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTCFP49711 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTCFP49711 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTCFP49711 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTCFP49711 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTCFP49711 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTCFP49711 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTCFP49711 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTCFP49711 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTCFP49711 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTCFP49711 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTCFP49711 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTCFP49711 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTCFP49711 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTCFP49711 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTCFP49711 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CTCFP49711 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTCFP49711 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTCFP49711 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTCFP49711 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTCFP49711 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTCFP49711 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTCFP49711 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTCFP49711 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTCFP49711 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTCFP49711 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTCFP49711 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTCFP49711 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTCFP49711 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTCFP49711 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTCFP49711 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTCFP49711 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTCFP49711 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTCFP49711 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTCFP49711 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTCFP49711 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTCFP49711 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTCFP49711 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTCFP49711 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTCFP49711 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTCFP49711 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTCFP49711 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTCFP49711 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTCFP49711 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTCFP49711 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTCFP49711 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTCFP49711 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTCFP49711 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTCFP49711 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTCFP49711 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTCFP49711 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTCFP49711 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTCFP49711 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CTCFP49711 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CTCFP49711 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTCFP49711 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTCFP49711 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTCFP49711 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTCFP49711 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTCFP49711 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CTCFP49711 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTCFP49711 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTCFP49711 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTCFP49711 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTCFP49711 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTCFP49711 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTCFP49711 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CTCFP49711 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTCFP49711 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTCFP49711 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTCFP49711 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTCFP49711 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTCFP49711 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTCFP49711 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTCFP49711 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTCFP49711 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTCFP49711 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTCFP49711 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms