Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LMAN1P49257 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMAN1P49257 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMAN1P49257 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms