Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPIAP49247 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPIAP49247 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPIAP49247 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPIAP49247 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPIAP49247 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPIAP49247 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPIAP49247 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPIAP49247 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPIAP49247 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPIAP49247 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPIAP49247 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPIAP49247 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPIAP49247 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPIAP49247 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPIAP49247 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPIAP49247 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPIAP49247 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPIAP49247 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPIAP49247 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPIAP49247 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPIAP49247 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPIAP49247 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPIAP49247 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPIAP49247 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPIAP49247 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPIAP49247 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPIAP49247 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPIAP49247 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPIAP49247 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPIAP49247 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPIAP49247 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPIAP49247 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPIAP49247 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPIAP49247 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPIAP49247 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPIAP49247 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPIAP49247 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPIAP49247 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPIAP49247 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPIAP49247 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPIAP49247 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPIAP49247 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPIAP49247 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPIAP49247 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPIAP49247 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPIAP49247 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPIAP49247 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPIAP49247 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPIAP49247 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPIAP49247 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPIAP49247 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPIAP49247 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPIAP49247 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPIAP49247 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPIAP49247 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPIAP49247 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPIAP49247 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPIAP49247 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPIAP49247 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPIAP49247 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPIAP49247 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPIAP49247 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPIAP49247 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPIAP49247 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPIAP49247 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPIAP49247 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPIAP49247 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPIAP49247 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPIAP49247 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPIAP49247 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPIAP49247 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPIAP49247 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPIAP49247 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms