Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX1P48742 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX1P48742 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX1P48742 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX1P48742 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX1P48742 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX1P48742 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX1P48742 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX1P48742 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX1P48742 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX1P48742 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX1P48742 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX1P48742 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX1P48742 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX1P48742 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX1P48742 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX1P48742 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX1P48742 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX1P48742 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX1P48742 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX1P48742 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX1P48742 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX1P48742 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX1P48742 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX1P48742 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX1P48742 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX1P48742 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX1P48742 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX1P48742 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX1P48742 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX1P48742 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX1P48742 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX1P48742 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX1P48742 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX1P48742 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LHX1P48742 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LHX1P48742 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LHX1P48742 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LHX1P48742 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LHX1P48742 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX1P48742 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX1P48742 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX1P48742 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX1P48742 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX1P48742 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX1P48742 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX1P48742 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX1P48742 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX1P48742 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX1P48742 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX1P48742 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX1P48742 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX1P48742 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX1P48742 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX1P48742 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX1P48742 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX1P48742 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX1P48742 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX1P48742 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX1P48742 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX1P48742 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX1P48742 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX1P48742 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX1P48742 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX1P48742 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX1P48742 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX1P48742 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX1P48742 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX1P48742 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX1P48742 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX1P48742 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX1P48742 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX1P48742 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX1P48742 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX1P48742 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX1P48742 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX1P48742 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX1P48742 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX1P48742 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX1P48742 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX1P48742 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX1P48742 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX1P48742 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX1P48742 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX1P48742 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX1P48742 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX1P48742 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX1P48742 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX1P48742 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX1P48742 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX1P48742 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX1P48742 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX1P48742 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX1P48742 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX1P48742 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX1P48742 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX1P48742 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX1P48742 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX1P48742 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX1P48742 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms