Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC4P43686 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC4P43686 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC4P43686 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC4P43686 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC4P43686 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC4P43686 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC4P43686 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC4P43686 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC4P43686 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC4P43686 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC4P43686 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC4P43686 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC4P43686 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMC4P43686 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC4P43686 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms